蚯蚓为典型的索式神经。**神经系统有位于*3体节背侧的一对咽上神经节（脑）及位于*3和*4体节间腹侧的咽下神经节，二者以围咽神经相连。自咽下神经节伸向体后的一条腹神经索，于每节内有一神经节）。外围神经系统有由咽上神经节前侧发出的8～10对神经，分布到口前叶、口腔等处；咽下神经节分出神经至体前端几个体节的体壁上。腹神经索的每个神经节均发出3对神经分布在体壁和各器官、由咽上神经节伸出神经至消化管称为交感神经系统（sympathetic nerve system）。

外周神经系统的每条神经都含有感觉纤维和运动纤维，有传导和反应机能。感觉神经细胞，能将上皮接受的刺激传递到腹神经素的调节神经元（adjustor neuron）,再将冲动传导至运动神经细胞，经神经纤维连于肌肉等反应器，引起反应，这是简单的反射弧。腹神经索中的3条巨纤维（giant fiber），贯穿全索，传递冲动的速度较快，故蚯蚓受到刺激反应迅速。
生殖系统
雌性生殖器官：有卵巢1对，很小，由许多较细的卵巢管组成，位*13体节前隔膜后侧，卵漏斗（oviduct funnel）一对，位*13体节后隔膜前侧，后接短的输卵管（oviduct）。两输卵管在*14体节腹侧腹神经索下会合，开口于此腹中线，称雌生殖孔。另有纳精翼（seminal receptacle）3对（P. differingens为4对，P. aspergillum和P. californica为2对），位*7.8.9体节内。纳精囊由坛（ampullaa）、坛管和一盲管（diverticulum）构成。为储存精子之处。纳精囊孔开口子6/7.7/8.8/9体节之间腹面两侧。
雄性生殖器官：精巢2对，很小，位*10及11体节内的精巢囊（seminal sac）内，精漏斗 2对，紧靠精巢下方，前端膨大，口具纤毛，后接细的输精管。2管于*13体节内合为一条，向后伸，开口于*18体节两侧，为雄性生殖孔。**腺（prostate gland）一对，位雄生殖孔一侧，**腺管开口于输精管末端，分泌粘波与精子的活动和营养有关、精巢囊与其后*11及12体节内的贮精囊（seminal vesicle）相通，贮精囊内充满营养液。精巢产生精细胞后，先入贮精囊内发育，待形成精子，再回到精巢囊，经精漏斗由输精管输

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